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长荣海事博物馆的设立是长荣集团总裁张荣发先生多年来的心愿，希望藉由海事博物馆阐述张总裁与海洋的深厚情感及推广台湾的海事教育。这是一间以海事为主题的博物馆，适合不同世代、不同族群来馆参访。

馆内大量收藏了种类丰富的模型船，从远古人类以挖凿方式建造的独木舟，到西方所发展的各式帆船、机械动力船、工作船；还有展现台湾海岛民情的竹筏，以及具有宗教信仰意义的王船等。

其次，馆中亦展出为数不少以海洋为背景的画作，年代横跨18到20世纪，从烽火连天的战争场景到波光潋灩的海上帆影，可逐一欣赏各时代画家笔下别具风情的海洋景象 。

此外，长荣海事博物馆亦有航海探索区。配合航海仪器及多媒体互动展示，让观众亲身体验海上航行的相关知识 。