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华冈博物馆之创议，发轫於华冈学府创校之时。创办人张其昀先生於民国 51 年(1962) 3 月 1 日订「创校旨趣书」，揭以「高等教育(大学)学术研究(研究院)服务推广(企业)三者一体」，为兴学创业之方针，采取「图书馆与博物馆」并重的原则，而有创设博物馆之议。

华冈博物馆筹备时期历时 8 年之久，前身为民国 52 年(1963)在大成馆成立之「中华文物陈列馆」、54 年(1965)迁入大仁馆，改为「文物博物馆」，58年(1969)改名为「国际华学资料展览馆」。为适应此种演进，经历三度的充实与发展，在文物徵集保管等日常行政方面，先於图书馆内设立博物馆，合称图书博物馆。随後在中华学术院内设博物馆组，专司其事。    

民国 60 年(1971)华冈博物馆在大义馆 6 楼正式成立，为国内第一所大学综合博物馆，亦是最具规模的大学社区博物馆。华冈博物馆一方面辅助教学，提供通识教育之资源，同时亦发挥社会教育与社区服务之功能。

民国 74 年(1985)起，董事长张镜湖博士决定筹建新的博物馆馆舍，与图书馆、资讯中心合并统一规划为晓峰纪念馆，87 年(1998)底硬体建设完成，88 年(1999) 3 月 1 日正式启用，馆名沿用「华冈博物馆」。

华冈博物馆的业务，以功能区分为典藏、展览、推广教育三大类。历任馆长潘维和、赵振绩、陈国宁、陈明湘、吴瑞秀、嵇若昕、刘梅琴馆长与同仁的努力推展之下，颇具规模，成为本校一大特色。

(资料来源：华冈博物馆官网)